Details for gene set KEGG_RENAL_CELL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	KEGG_RENAL_CELL_CARCINOMA
Enrichment Score (ES)	0.18287963
Normalized Enrichment Score (NES)	1.7987044
Nominal p-value	0.014
FDR q-value	0.11806881
FWER p-Value	0.774

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	SLC2A1	1791	0.294	-0.0822	Yes
2	PIK3R1	1822	0.289	-0.0695	Yes
3	GAB1	2041	0.257	-0.0670	Yes
4	AKT3	2072	0.254	-0.0543	Yes
5	HGF	2384	0.219	-0.0568	Yes
6	SOS2	2763	0.188	-0.0629	Yes
7	PIK3CA	3103	0.167	-0.0669	Yes
8	PTPN11	3250	0.157	-0.0604	Yes
9	VEGFC	3333	0.154	-0.0506	Yes
10	PIK3R3	3580	0.141	-0.0495	Yes
11	BRAF	3837	0.129	-0.0490	Yes
12	PIK3CG	3956	0.124	-0.0411	Yes
13	EPAS1	3969	0.124	-0.0275	Yes
14	CRK	4017	0.122	-0.0157	Yes
15	FLCN	4212	0.114	-0.0119	Yes
16	EP300	4571	0.102	-0.0169	Yes
17	VEGFA	4755	0.096	-0.0125	Yes
18	TGFA	4908	0.091	-0.0064	Yes
19	EGLN3	4947	0.090	0.0059	Yes
20	PIK3CB	4965	0.090	0.0192	Yes
21	PAK1	5002	0.089	0.0316	Yes
22	ARNT	5004	0.089	0.0458	Yes
23	MAPK1	5144	0.085	0.0526	Yes
24	AKT1	5405	0.078	0.0529	Yes
25	CREBBP	5434	0.077	0.0657	Yes
26	MET	5871	0.065	0.0565	Yes
27	VEGFB	5923	0.064	0.0680	Yes
28	TCEB2	6466	0.051	0.0531	Yes
29	FH	6558	0.049	0.0625	Yes
30	PAK2	6648	0.047	0.0720	Yes
31	KRAS	6957	0.041	0.0697	Yes
32	TGFB1	7321	0.033	0.0644	Yes
33	RAF1	7492	0.029	0.0695	Yes
34	AKT2	7783	0.023	0.0682	Yes
35	MAPK3	7950	0.020	0.0735	Yes
36	RAP1A	8006	0.019	0.0848	Yes
37	SOS1	8185	0.016	0.0895	Yes
38	EGLN1	8263	0.014	0.0997	Yes
39	VHL	8461	0.010	0.1033	Yes
40	RAC1	9060	-0.002	0.0854	Yes
41	TCEB1	9412	-0.009	0.0808	Yes
42	CUL2	9562	-0.012	0.0870	Yes
43	HIF1A	9859	-0.018	0.0854	Yes
44	HRAS	10032	-0.021	0.0904	Yes
45	PDGFB	10151	-0.023	0.0983	Yes
46	RBX1	10323	-0.026	0.1034	Yes
47	CRKL	10644	-0.033	0.1004	Yes
48	ARAF	10792	-0.036	0.1068	Yes
49	TGFB2	10886	-0.039	0.1161	Yes
50	TGFB3	11101	-0.044	0.1188	Yes
51	NRAS	11153	-0.045	0.1304	Yes
52	ETS1	11472	-0.053	0.1275	Yes
53	PAK4	11495	-0.053	0.1406	Yes
54	JUN	11703	-0.058	0.1438	Yes
55	FIGF	11727	-0.059	0.1568	Yes
56	MAP2K2	12201	-0.070	0.1456	Yes
57	RAP1B	12330	-0.073	0.1530	Yes
58	RAPGEF1	12367	-0.074	0.1654	Yes
59	PIK3R5	12488	-0.077	0.1732	Yes
60	CDC42	12574	-0.080	0.1829	Yes
61	EGLN2	12976	-0.091	0.1756	No
62	GRB2	13603	-0.112	0.1561	No
63	ARNT2	13950	-0.126	0.1518	No
64	PGF	13969	-0.126	0.1651	No
65	MAP2K1	14041	-0.131	0.1755	No
66	PAK3	14212	-0.139	0.1807	No
67	PAK6	14717	-0.165	0.1678	No
68	PIK3CD	15256	-0.205	0.1531	No
69	PIK3R2	16205	-0.318	0.1163	No
70	PAK7	18536	-3.541	0.0051	No